公办高职院校和民办高职院校在收费标准上存在以下显著差异：
学费
公办高职院校：学费相对较低，通常在每年 5000 元至 10,000 元之间。这是因为公办高职院校由国家或地方政府资助，有较多的财政经费支持。不过，一些热门专业或艺术类专业的学费可能会更高，部分地区个别公办学校的特殊专业学费也会超出这个范围，如福州职业技术学院的软件技术专业学费为 9000 元 / 学年。
民办高职院校：学费普遍高于公办高职院校，一般在每年 10,000 元至 20,000 元不等，部分专业可能高达 30,000 元以上甚至更高。民办高职院校需要自筹资金办学，运营成本主要依靠学费收入，同时还需考虑学校的设施建设、师资引进等方面的投入，所以学费较高。例如，闽南职业学院和厦门南洋职业学院的戏剧影视表演和影视编导专业，学费均为 38,000 元 / 学年。
住宿费
公办高职院校：住宿费根据学校住宿条件不同有所差异，一般在每年 500 元至 1500 元左右。如福建船政交通职业学院住宿费 550 元 / 生・学年（含空调），福建卫生职业技术学院四人间 1300 元 / 生・学年，六人间 870 - 970 元 / 生・学年。
民办高职院校：住宿费也因学校而异，通常在每年 800 元至 2000 元左右，一些设施较好的学校可能会更高。例如，石家庄工商职业学院八人间住宿费 780 元 / 年，四人间 1560 元 / 年。
除了学费和住宿费，部分学校可能还会收取教材费、实训费等其他费用，具体金额因学校和专业而异。
